More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04276 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  78.24 
 
 
642 aa  1019    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  71.79 
 
 
671 aa  952    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  100 
 
 
670 aa  1368    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  71.88 
 
 
647 aa  947    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.75 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  51.1 
 
 
642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  48.91 
 
 
647 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.59 
 
 
647 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  48.75 
 
 
642 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  50.59 
 
 
652 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  48.44 
 
 
647 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  48.83 
 
 
642 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  49.67 
 
 
628 aa  595  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3470  neutral zinc metallopeptidase M1 family protein  45.5 
 
 
629 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  47.56 
 
 
633 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  46.08 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.54 
 
 
595 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1367  leukotriene A4 hydrolase  44.37 
 
 
623 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.61 
 
 
606 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.05 
 
 
597 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1383  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  44.37 
 
 
623 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  43.84 
 
 
617 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2977  Leukotriene A4 hydrolase  43.89 
 
 
623 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  normal  0.0102393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1406  leukotriene A4 hydrolase  44.46 
 
 
623 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  45.8 
 
 
597 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2774  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  44.11 
 
 
605 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000499595  decreased coverage  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2706  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  43.94 
 
 
605 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383424  hitchhiker  0.0000144505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2765  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  44.67 
 
 
593 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  42.32 
 
 
615 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  43.82 
 
 
598 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  43.92 
 
 
604 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  43.74 
 
 
612 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.19072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  43.74 
 
 
598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3592  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  41.71 
 
 
648 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  35.15 
 
 
620 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82220  Probable leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  34.61 
 
 
635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.126377 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05812  Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6)(Leukotriene A(4) hydrolase)(LTA-4 hydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0W8]  34.39 
 
 
618 aa  300  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76777  leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  34.48 
 
 
626 aa  290  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937224  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04600  leukotriene-A4 hydrolase, putative  34.24 
 
 
479 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0099794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.03 
 
 
863 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  26.72 
 
 
905 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.87 
 
 
822 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.12 
 
 
551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.46 
 
 
859 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.36 
 
 
823 aa  115  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.04 
 
 
824 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  26.42 
 
 
688 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.37 
 
 
456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.67 
 
 
821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  24.34 
 
 
446 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  25.53 
 
 
875 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.17 
 
 
857 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.17 
 
 
857 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.75 
 
 
865 aa  107  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  28.64 
 
 
862 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6240  peptidase, M1 (aminopeptidase N) family  26.49 
 
 
429 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00488236  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
860 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.67 
 
 
499 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.13 
 
 
846 aa  104  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  28.4 
 
 
861 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  25.29 
 
 
827 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  25.33 
 
 
446 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
882 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.31 
 
 
859 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  28.27 
 
 
856 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.89 
 
 
458 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.22 
 
 
442 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.07 
 
 
778 aa  99.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.67 
 
 
877 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  23.88 
 
 
842 aa  98.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.11 
 
 
905 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  26.02 
 
 
829 aa  98.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.73 
 
 
857 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.01 
 
 
517 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.74 
 
 
768 aa  97.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.53 
 
 
442 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.53 
 
 
442 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1059  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.61 
 
 
485 aa  97.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.725345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.29 
 
 
830 aa  96.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.59 
 
 
845 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.22 
 
 
835 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  26.29 
 
 
857 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.86 
 
 
516 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2774  aminopeptidase N  27.17 
 
 
898 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  24.71 
 
 
854 aa  94.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0876  aminopeptidase N  26.65 
 
 
897 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.11 
 
 
866 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.59 
 
 
784 aa  93.6  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.21 
 
 
859 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0542  aminopeptidase N  24.21 
 
 
878 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.644765  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.54 
 
 
823 aa  93.2  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.57 
 
 
686 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0476  aminopeptidase N  24.21 
 
 
878 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.59204 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  25.21 
 
 
844 aa  92.8  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  28.29 
 
 
867 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.49 
 
 
865 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0513  aminopeptidase N  24.48 
 
 
878 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  28.29 
 
 
867 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.68 
 
 
863 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  28.29 
 
 
867 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>