30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2203 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  38.91 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  35.97 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  34.93 
 
 
293 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  35.56 
 
 
279 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  34.4 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  30.57 
 
 
429 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  29.93 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  23.85 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  23.43 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  23.16 
 
 
471 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  28.47 
 
 
474 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
468 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
963 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  23.05 
 
 
408 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  22.68 
 
 
471 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  26.58 
 
 
437 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  26.4 
 
 
456 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.79 
 
 
1078 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  21.9 
 
 
1060 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  25.14 
 
 
530 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.65 
 
 
970 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  26.97 
 
 
553 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  23.41 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  25.14 
 
 
546 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  23.13 
 
 
462 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>