12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1976 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  83.65 
 
 		 471 aa  786    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  944    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  38.67 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  42.2 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  24.48 
 
 		 982 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  23.21 
 
 		 286 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  23.55 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.19 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  25.45 
 
 		 279 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  26.42 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  22.5 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  24.01 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>