More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1730 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 982 aa  1978    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.44 
 
 		 1028 aa  257  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.78 
 
 		 1078 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  24.03 
 
 		 1060 aa  198  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1012 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1041 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1041 aa  188  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1041 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1048 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0419  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1129 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  27.12 
 
 		 881 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1087 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  22.8 
 
 		 1072 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  27.88 
 
 		 970 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  39.32 
 
 		 1005 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.68 
 
 		 976 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  23.42 
 
 		 901 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.74 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.39 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  37.93 
 
 		 316 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  40.19 
 
 		 956 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.43 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.13 
 
 		 428 aa  80.1  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  36.94 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  36.94 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.85 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.81 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  23.21 
 
 		 918 aa  77  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.18 
 
 		 970 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  33.83 
 
 		 430 aa  77.4  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  36.94 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.38 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  32.41 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 969 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  31.54 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  31.39 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  31.39 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  34.23 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  31.39 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  44.04 
 
 		 1206 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  31.9 
 
 		 422 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.29 
 
 		 407 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 428 aa  74.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.9 
 
 		 422 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  33.94 
 
 		 457 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  35.14 
 
 		 436 aa  73.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 435 aa  73.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 441 aa  73.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  44.04 
 
 		 1021 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  36.94 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  32.24 
 
 		 430 aa  73.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  34.38 
 
 		 1010 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  33.08 
 
 		 434 aa  73.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  42.34 
 
 		 1078 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  31.58 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.33 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.98 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.96 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  34.17 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  34.23 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  31.63 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.72 
 
 		 430 aa  72  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.33 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  28.83 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.65 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 444 aa  71.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  30.66 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  32.02 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 430 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.74 
 
 		 434 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.52 
 
 		 462 aa  70.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  41.44 
 
 		 1077 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3087  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000560471  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1249  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000163249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.21 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.86 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.78 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.14 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>