236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3748 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  100 
 
 
1012 aa  2050    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  74.09 
 
 
1041 aa  1479    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  74.38 
 
 
1041 aa  1486    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  74.38 
 
 
1041 aa  1488    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  26.23 
 
 
982 aa  202  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.39 
 
 
1078 aa  154  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.86 
 
 
1028 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  21.11 
 
 
1087 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  26.7 
 
 
1060 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  32 
 
 
442 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  32 
 
 
442 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  32 
 
 
442 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.82 
 
 
432 aa  67  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  32 
 
 
440 aa  66.6  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  21.46 
 
 
1072 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  32.81 
 
 
419 aa  65.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  32.81 
 
 
419 aa  65.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30 
 
 
441 aa  65.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.51 
 
 
461 aa  65.1  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  30 
 
 
442 aa  64.7  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.67 
 
 
442 aa  64.7  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  30 
 
 
442 aa  64.7  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  30 
 
 
442 aa  64.7  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  30 
 
 
442 aa  64.7  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  30.67 
 
 
442 aa  64.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.72 
 
 
434 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  30.26 
 
 
717 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.3 
 
 
428 aa  64.3  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32.28 
 
 
438 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  29.69 
 
 
442 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.54 
 
 
403 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.28 
 
 
425 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.11 
 
 
428 aa  63.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  29.33 
 
 
442 aa  63.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  27.06 
 
 
431 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.13 
 
 
442 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.87 
 
 
430 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.67 
 
 
441 aa  63.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  29.69 
 
 
442 aa  62.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.42 
 
 
1010 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.81 
 
 
430 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.33 
 
 
426 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.81 
 
 
430 aa  62  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.33 
 
 
429 aa  62.4  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  25.73 
 
 
431 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  25.73 
 
 
431 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.5 
 
 
572 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.66 
 
 
434 aa  61.6  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  28.91 
 
 
450 aa  61.6  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  28.68 
 
 
1005 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  31.21 
 
 
1042 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.31 
 
 
431 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.31 
 
 
431 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  34.45 
 
 
432 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  30.91 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.27 
 
 
436 aa  60.1  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  27.03 
 
 
408 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.3 
 
 
435 aa  59.7  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.45 
 
 
446 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.92 
 
 
567 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  28.91 
 
 
423 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  27.72 
 
 
1014 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  25.31 
 
 
431 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.45 
 
 
446 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  33.61 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  33.61 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.69 
 
 
434 aa  58.9  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.45 
 
 
446 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  29.19 
 
 
463 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  28.91 
 
 
433 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.54 
 
 
445 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.19 
 
 
463 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  28.91 
 
 
423 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.34 
 
 
428 aa  58.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  29.19 
 
 
463 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  29.19 
 
 
433 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  29.19 
 
 
431 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.65 
 
 
408 aa  58.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.19 
 
 
430 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.19 
 
 
430 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  29.19 
 
 
433 aa  58.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  30.5 
 
 
1042 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28.12 
 
 
423 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.5 
 
 
1040 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.48 
 
 
450 aa  58.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.75 
 
 
440 aa  57.4  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.93 
 
 
424 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  29.69 
 
 
433 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  29.69 
 
 
433 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.28 
 
 
441 aa  57.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.85 
 
 
446 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  25.55 
 
 
1048 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.33 
 
 
442 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.01 
 
 
421 aa  57.4  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  29.46 
 
 
431 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  27.33 
 
 
442 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  29.46 
 
 
431 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.83 
 
 
422 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  35.92 
 
 
430 aa  57  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  29.53 
 
 
436 aa  57  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>