296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0966 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  54.25 
 
 		 970 aa  1079    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  100 
 
 		 976 aa  2002    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1021 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  29.11 
 
 		 956 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  27.33 
 
 		 918 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  30.76 
 
 		 1078 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  29.52 
 
 		 1077 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 1206 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  28.25 
 
 		 901 aa  228  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  29.09 
 
 		 881 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  23.65 
 
 		 970 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  25.2 
 
 		 977 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  22.32 
 
 		 979 aa  109  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6241  hypothetical protein  25.13 
 
 		 919 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.11 
 
 		 1028 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  22.68 
 
 		 982 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  20.54 
 
 		 914 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  29.02 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.96 
 
 		 1078 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1427  hypothetical protein  23.25 
 
 		 936 aa  78.2  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  23.22 
 
 		 947 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  27.68 
 
 		 1062 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.03 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  27.68 
 
 		 1062 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.68 
 
 		 1062 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  27.31 
 
 		 1069 aa  72  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  27.68 
 
 		 1049 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0824  hypothetical protein  26.87 
 
 		 814 aa  71.2  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.95 
 
 		 1138 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.72 
 
 		 717 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  26.86 
 
 		 1081 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  26.34 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  27.46 
 
 		 1065 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.63 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.93 
 
 		 1082 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.35 
 
 		 428 aa  67.4  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2270  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1010 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.122656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0894  hypothetical protein  26.64 
 
 		 821 aa  67  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0819646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.03 
 
 		 1005 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.34 
 
 		 1067 aa  67  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.44 
 
 		 1090 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  21.67 
 
 		 1048 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.24 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.5 
 
 		 1040 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  25.93 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.68 
 
 		 1042 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1042 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.63 
 
 		 435 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  27.08 
 
 		 434 aa  63.9  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.23 
 
 		 1066 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  24.91 
 
 		 445 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.74 
 
 		 426 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  26.99 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  28.24 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  21.69 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.23 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.38 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  25.91 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.38 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  26.7 
 
 		 428 aa  60.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3061  transcriptional regulator domain-containing protein  25.34 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0196528  hitchhiker  0.000417149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.32 
 
 		 415 aa  60.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  25.46 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25.2 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  24.9 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  31.67 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  24.6 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.71 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  32.72 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  25.38 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1312  TolB domain-containing protein  25 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.05 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  27.61 
 
 		 426 aa  57.8  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  27.33 
 
 		 442 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.61 
 
 		 444 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 451 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  23.64 
 
 		 438 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 428 aa  57.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0554  putative transcriptional regulator, CadC  29.2 
 
 		 702 aa  57.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.79 
 
 		 441 aa  57  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1111 aa  57  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.89 
 
 		 438 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 421 aa  57  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.82 
 
 		 434 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.65 
 
 		 443 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  26.52 
 
 		 443 aa  57  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 445 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 450 aa  57  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  25.46 
 
 		 716 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 969 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.35 
 
 		 444 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.46 
 
 		 572 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.55 
 
 		 427 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 642 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.91 
 
 		 429 aa  56.2  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  24.9 
 
 		 440 aa  55.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 441 aa  55.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.74 
 
 		 457 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>