20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4127 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  913    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  38.18 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  39.34 
 
 		 471 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  38.52 
 
 		 474 aa  269  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  24.55 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  23.36 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  23.11 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  26.72 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  26.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.11 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  23.34 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  25.85 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  29.81 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>