31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0571 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  830    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  84.56 
 
 		 408 aa  697    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  81.7 
 
 		 408 aa  644    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  30.87 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  23.43 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  24.28 
 
 		 982 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.31 
 
 		 1078 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  25.4 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  24.88 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  24.55 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  26.94 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.38 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  24.24 
 
 		 304 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1012 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  23.55 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0685  hypothetical protein  27.31 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  22.7 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1511  hypothetical protein  24.06 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1041 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1041 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1041 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  28.48 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4197  hypothetical protein  27.88 
 
 		 749 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124038  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  30.43 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>