20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3297 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  98.91 
 
 
275 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  98.91 
 
 
275 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  54.83 
 
 
275 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  52.12 
 
 
257 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  52.36 
 
 
283 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  35.37 
 
 
462 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  34.39 
 
 
410 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  31.67 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
421 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  28.06 
 
 
426 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  28.19 
 
 
444 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  31.51 
 
 
391 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  29.81 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  32.17 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
412 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
420 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 
429 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>