19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1381 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  37.1 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  36.52 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  33.05 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3123  hypothetical protein  32.73 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.27337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2858  hypothetical protein  34.72 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.505703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  34.39 
 
 		 276 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  35.26 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  41.51 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  35.14 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  25.56 
 
 		 304 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  35.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  25.75 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.13 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>