31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3073 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  817    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  36.09 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  52.59 
 
 		 252 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  37.57 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3123  hypothetical protein  37.47 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.27337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2858  hypothetical protein  31.51 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.505703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  29.48 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3285  hypothetical protein  26.02 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  31.67 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  31.98 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  31.98 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  32.88 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  31.3 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4197  hypothetical protein  27.64 
 
 		 749 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124038  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  31.13 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  29.46 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  29.29 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  28.24 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  23.29 
 
 		 1060 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  26.48 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.4 
 
 		 1028 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8241  hypothetical protein  21.8 
 
 		 462 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  26.99 
 
 		 546 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  43.33 
 
 		 391 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  28.48 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  26.99 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>