25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4269 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1150    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  93.35 
 
 
546 aa  940    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  90.19 
 
 
530 aa  927    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  71.13 
 
 
553 aa  678    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  36.68 
 
 
544 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  26.82 
 
 
429 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  25.91 
 
 
304 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  26.15 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
963 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  25.91 
 
 
293 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
1001 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  22.76 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
421 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 
412 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  28.89 
 
 
294 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
639 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  24.44 
 
 
408 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  26.48 
 
 
426 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  19.76 
 
 
268 aa  48.5  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  25.86 
 
 
956 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.04 
 
 
725 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
198 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>