32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4423 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  65.81 
 
 
546 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  70.65 
 
 
530 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  65.88 
 
 
585 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4423  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1095    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  34.65 
 
 
544 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  23.6 
 
 
304 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 
1001 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
963 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  25.71 
 
 
426 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  25.51 
 
 
293 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
420 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
468 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
421 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 
412 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
412 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  24.51 
 
 
294 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 
429 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
828 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 
198 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
828 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  19.05 
 
 
268 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2470  hypothetical protein  21.03 
 
 
279 aa  47  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000051933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
593 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  25.1 
 
 
956 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
2262 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 
395 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  25.15 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  25.71 
 
 
286 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
673 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
637 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>