39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_510 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0571  hypothetical protein  85.09 
 
 		 408 aa  692    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.042047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  827    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0545  hypothetical protein  84.8 
 
 		 408 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1905  hypothetical protein  30 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0772428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2203  hypothetical protein  23.85 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.27 
 
 		 1078 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3024  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  22.63 
 
 		 982 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3748  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1012 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2344  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000027404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  23.7 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1762  TPR domain-containing protein  25.27 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0497958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0685  hypothetical protein  29.03 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3469  hypothetical protein  27.42 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.068421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  26.49 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0071  hypothetical protein  30.65 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2700  hypothetical protein  26.84 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2418  hypothetical protein  24.09 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3686  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3755  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1041 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4269  hypothetical protein  24.44 
 
 		 585 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4403  hypothetical protein  24.05 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3616  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1041 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  23.23 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1976  hypothetical protein  26.42 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  31.3 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  25.85 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  22.55 
 
 		 293 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  25.19 
 
 		 633 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 963 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4208  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 1001 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0104266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4197  hypothetical protein  28.4 
 
 		 749 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124038  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0587  hypothetical protein  27.43 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.20698  hitchhiker  0.0000000000699269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3295  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  31.58 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>