19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3286 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160787  normal  0.0858239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3297  hypothetical protein  98.91 
 
 		 276 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514363  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3551  hypothetical protein  55.04 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12217  hypothetical protein  52.54 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.616096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2960  hypothetical protein  52.57 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3048  hypothetical protein  35.81 
 
 		 462 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1381  hypothetical protein  34.84 
 
 		 410 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3073  hypothetical protein  31.98 
 
 		 426 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000435746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2693  hypothetical protein  32.08 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6077  hypothetical protein  27.41 
 
 		 444 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.596344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 421 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3244  hypothetical protein  30.14 
 
 		 391 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00420433  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1932  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  28.57 
 
 		 426 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000295062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1566  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 420 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2418  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000313071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4127  hypothetical protein  28.85 
 
 		 456 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 412 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.255414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 468 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>