15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0022 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1079    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2280  hypothetical protein  34.9 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  30.24 
 
 		 559 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2064  hypothetical protein  27.82 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  25.37 
 
 		 529 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 565 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1900  hypothetical protein  26.39 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3736  hypothetical protein  25.32 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0978251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  26.49 
 
 		 507 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3174  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  0.379297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 377 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4424  hypothetical protein  27.59 
 
 		 546 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>