86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2046 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2046  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 479 aa  919    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  36.07 
 
 		 613 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1297 aa  66.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.1 
 
 		 929 aa  63.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 927 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  20.61 
 
 		 670 aa  57  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 		 1979 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 		 836 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 923 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1049 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.87 
 
 		 745 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 329 aa  54.3  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.46 
 
 		 623 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 		 543 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 931 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.37 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1069 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.7 
 
 		 837 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 944 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 4079 aa  50.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 2262 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 214 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  19.48 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 240 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 362 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2903  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00249515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2976  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3201  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 288 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.84 
 
 		 614 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1276 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 515 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  27.74 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 219 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 		 1067 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 767 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.91 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.25 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 652 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 		 652 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.17 
 
 		 3145 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 906 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 652 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 		 601 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.67 
 
 		 738 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0228  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.390102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 793 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 652 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 		 2240 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 700 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 632 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  21.56 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.75 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  21.98 
 
 		 1007 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.8 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.85 
 
 		 632 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 886 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 689 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 781 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 		 1056 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.06 
 
 		 648 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 287 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 257 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 1421 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 		 707 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.83 
 
 		 340 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 935 aa  43.5  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  27.06 
 
 		 636 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  30.43 
 
 		 815 aa  43.5  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 639 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>