256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0843 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 330 aa  646    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  64.01 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1250  tetratricopeptide TPR_2  33.82 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.738804  normal  0.817659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  49.3 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0781  cytochrome c family protein  35.24 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 4079 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.71 
 
 		 560 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  28.8 
 
 		 198 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  31.36 
 
 		 163 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 602 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.97 
 
 		 810 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 1486 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.09 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 890 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  44.29 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  41.43 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 878 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  29.25 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  35.23 
 
 		 701 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 917 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  44.29 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 632 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 110 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  29.66 
 
 		 163 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  32.81 
 
 		 111 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 143 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  27.37 
 
 		 120 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 532 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  44.59 
 
 		 528 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 532 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.27 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.96 
 
 		 739 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 		 535 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 532 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 		 535 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 		 512 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 280 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 532 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 636 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  31.37 
 
 		 545 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  35.23 
 
 		 152 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 193 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 927 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 531 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.57 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.87 
 
 		 545 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  42.47 
 
 		 521 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.36 
 
 		 739 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.08 
 
 		 1694 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  37.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1121 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 525 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1206  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.417505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  39.44 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 518 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 708 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  41.1 
 
 		 524 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 617 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1178 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 513 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  33.33 
 
 		 118 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  31.91 
 
 		 826 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  33.33 
 
 		 118 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  34.25 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 955 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  33.33 
 
 		 118 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>