232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1906 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 244 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  57.44 
 
 		 243 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  54.96 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.93 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.72 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  38.71 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  34.6 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.13 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.43 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.79 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  28.44 
 
 		 301 aa  95.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  31 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  30.22 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  30.22 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.89 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.52 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.52 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  26.5 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  29.15 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.06 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  28.64 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  28.71 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  27.98 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.42 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  28.89 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  25.41 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  25.41 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  27.98 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  27.98 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  27.39 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  25.12 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.18 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  27.36 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.98 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  29.53 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  26.03 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  27.78 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  28.74 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  26.77 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  27.31 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  27.4 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  29.57 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  24.42 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.41 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.89 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  27.87 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.11 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.94 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  28.76 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  25.37 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.94 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.4 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.08 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.84 
 
 		 299 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.13 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.18 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  27.78 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  25.76 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.68 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  26.37 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  28.07 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  28.07 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.65 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.65 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.65 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  27.38 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  23.22 
 
 		 287 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.15 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.46 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  24.64 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.79 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  25.37 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  24.64 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  23.72 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.49 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.69 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.16 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>