30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0544 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0544  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1077 aa  2227    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000321228  normal  0.11155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.27 
 
 		 1000 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 804 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 269 aa  48.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  34.41 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 709 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 272 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  36.76 
 
 		 258 aa  46.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  30.97 
 
 		 709 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  35.71 
 
 		 239 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  38.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  38.89 
 
 		 258 aa  46.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 1297 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 262 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  30.69 
 
 		 264 aa  45.8  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 995 aa  45.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 1108 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>