211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2843 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  98.58 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  69.2 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  74.81 
 
 		 288 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  65.12 
 
 		 288 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  63.74 
 
 		 287 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  63.36 
 
 		 287 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  62.07 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  51.76 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  50.38 
 
 		 284 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  48.92 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.86 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  50 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  50 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  47.5 
 
 		 298 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  54.11 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  54.11 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.72 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  53.68 
 
 		 291 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  52.07 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.46 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  49.61 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  48.18 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  46.37 
 
 		 291 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  44.89 
 
 		 391 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  40.59 
 
 		 279 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  39.48 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.56 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  40.59 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  40.49 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  39.72 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  39.72 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  40.16 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  39 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  45.07 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  40.27 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  39.92 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  43.46 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.05 
 
 		 319 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.7 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  32.24 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  29.69 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  28.8 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  28.67 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  30.2 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  30.2 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.14 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  29.96 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  29.2 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  28.8 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  27.97 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  31.58 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.1 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  28.17 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.52 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  27.27 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  26.78 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  29 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  27.01 
 
 		 272 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  25.53 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  30.08 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  30.08 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  27.01 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.56 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  27.24 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  26.38 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.22 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  26.09 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  26.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  26.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  26.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  25.7 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  27.52 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.23 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  28.93 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  25.48 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  25.96 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  25.96 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  25.96 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  25.96 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  26.21 
 
 		 339 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.21 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.77 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 253 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  26.21 
 
 		 339 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.39 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  28.17 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  25.66 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>