52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00632 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  70.05 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  26.18 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  26.01 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.76 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  27.01 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  27.1 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  24.13 
 
 		 510 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  23.96 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  24.32 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  24.85 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  26.81 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  26.65 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  25.43 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  25.91 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  25.52 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  25.12 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  24.36 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  27.11 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  20.42 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  26.89 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  28.63 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  24.34 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  26.35 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  22.94 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  29.09 
 
 		 905 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 985 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.03 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 833 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 1429 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 201 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.69 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.39 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02383  response regulator  30.09 
 
 		 655 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>