52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001861 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  100 
 
 		 407 aa  819    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  70.05 
 
 		 404 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  26.15 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  26.26 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  28.21 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  28.34 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  27.46 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  26.63 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  24.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  24.51 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  23.99 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  30.19 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  24.94 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  26.5 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  26.82 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  24.03 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  24.28 
 
 		 446 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  20.27 
 
 		 492 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  23.29 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  24.67 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  26.61 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  24.49 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  26.19 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  23.6 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  22.05 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  24.85 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.69 
 
 		 837 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  20.9 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  22.79 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.43 
 
 		 594 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02383  response regulator  32.17 
 
 		 655 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1297 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1676 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 573 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 827 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 804 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  19.02 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>