96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1322 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
413 aa  815    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  42.09 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 
420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  37.63 
 
 
386 aa  237  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  33.85 
 
 
421 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  34.58 
 
 
411 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
427 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  31.98 
 
 
425 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  32.49 
 
 
412 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  32.24 
 
 
424 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.18 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 
599 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.38 
 
 
677 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  36.36 
 
 
583 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
594 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  35.94 
 
 
592 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  36.07 
 
 
619 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
592 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
607 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
722 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
617 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 
593 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
574 aa  53.1  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
572 aa  53.1  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
566 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
566 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
593 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
616 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
566 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
562 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
585 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
579 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
607 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
607 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
599 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
607 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.1 
 
 
581 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
642 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
565 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
595 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 
567 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
621 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
621 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
584 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  36.62 
 
 
635 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  35.94 
 
 
606 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
622 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  24.75 
 
 
609 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
613 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
576 aa  47.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.09 
 
 
610 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
610 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
572 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  34.38 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  31.15 
 
 
566 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.03 
 
 
566 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  44 
 
 
573 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
607 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
607 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
607 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  36.84 
 
 
642 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  38.6 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
581 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  25.32 
 
 
625 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
621 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 
563 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5712  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
572 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6465  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592241  normal  0.571031 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6947  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148309  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  33.93 
 
 
620 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  35.09 
 
 
645 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
804 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  33.33 
 
 
613 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.09 
 
 
645 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 
616 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.51 
 
 
548 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
619 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
613 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  28.57 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
568 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
617 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 
587 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  35.09 
 
 
559 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
592 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>