78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0518 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  97.33 
 
 
425 aa  770    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  100 
 
 
412 aa  814    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  95.38 
 
 
424 aa  757    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  42.67 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  33.25 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
420 aa  203  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  31.4 
 
 
421 aa  188  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  30.29 
 
 
386 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
427 aa  142  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
722 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 
557 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.46 
 
 
599 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 
574 aa  61.6  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  25.73 
 
 
619 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  45 
 
 
677 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
563 aa  56.6  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.22 
 
 
583 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
562 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
565 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
464 aa  53.9  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 
573 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
576 aa  52.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 
592 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 
594 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.37 
 
 
548 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
617 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 
593 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.75 
 
 
571 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
592 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
567 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  23.56 
 
 
606 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.79 
 
 
593 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
607 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
599 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 
566 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
579 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
566 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
575 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
566 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  40.43 
 
 
621 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  40.43 
 
 
621 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 
606 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
642 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
591 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 
621 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.55 
 
 
581 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 
610 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
610 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
581 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
622 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  37.93 
 
 
562 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
595 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
585 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6465  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592241  normal  0.571031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
607 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5712  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
586 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  33 
 
 
226 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  29.79 
 
 
551 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
607 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 
482 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
607 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
619 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 
566 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
613 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 
607 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
607 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>