71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0605 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  100 
 
 		 425 aa  836    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  97.33 
 
 		 412 aa  771    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  95.48 
 
 		 424 aa  770    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  40.52 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  33.25 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  31.22 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  30.29 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 722 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 		 574 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  45 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.22 
 
 		 583 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.75 
 
 		 619 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 573 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 576 aa  53.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.07 
 
 		 548 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 567 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.75 
 
 		 571 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 		 606 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.79 
 
 		 593 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 607 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 599 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 		 566 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  23.78 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 579 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 566 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  40.43 
 
 		 621 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  40.43 
 
 		 621 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 591 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 571 aa  46.6  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 581 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 		 581 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 		 621 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 610 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  37.93 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 622 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 		 566 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  32.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6465  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592241  normal  0.571031 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5712  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>