136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1307 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  852    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  37.27 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  33.06 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  32.52 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  31.22 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  23.5 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 572 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 616 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  24.11 
 
 		 575 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 592 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 563 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 566 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 566 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 575 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  20.82 
 
 		 574 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  26.15 
 
 		 635 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  25.64 
 
 		 642 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 599 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 571 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 		 548 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  36.54 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 607 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  25.64 
 
 		 645 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  28 
 
 		 609 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 579 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.48 
 
 		 619 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 566 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 642 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 594 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 573 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 573 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 573 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 606 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  25.33 
 
 		 616 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 584 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 592 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  27.85 
 
 		 620 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 568 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 622 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  30.99 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 573 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  20.82 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 566 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 610 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 610 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.96 
 
 		 573 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 585 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 918 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  27.27 
 
 		 559 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 559 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>