45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0925 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  100 
 
 		 411 aa  813    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  40.52 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  42.67 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  31.98 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  32.52 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  29.33 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 427 aa  145  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 565 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 567 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.03 
 
 		 548 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  40.68 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 563 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  33.9 
 
 		 583 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 		 594 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 		 566 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  32.2 
 
 		 592 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 722 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 593 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.2 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 562 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 607 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 573 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 572 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.32 
 
 		 882 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 566 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 568 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 566 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 492 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 		 573 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>