More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1527 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 619 aa  1197    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  33.64 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  33.89 
 
 		 590 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  33.52 
 
 		 575 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  33.28 
 
 		 575 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 573 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 573 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 575 aa  208  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  33.47 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  33.96 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  30.07 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.06 
 
 		 562 aa  171  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 581 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  30.64 
 
 		 551 aa  144  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 599 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  29.73 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 571 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 607 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 		 591 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  29.42 
 
 		 559 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  35.18 
 
 		 616 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  29.26 
 
 		 635 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 595 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  34.58 
 
 		 625 aa  123  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 		 606 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  35.1 
 
 		 609 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  31.8 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.83 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 553 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  34.68 
 
 		 620 aa  111  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 603 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  32.77 
 
 		 494 aa  110  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  39.47 
 
 		 495 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  38.69 
 
 		 645 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 562 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.69 
 
 		 645 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  38.07 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  34.55 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.62 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 581 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.27 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.9 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.87 
 
 		 619 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.36 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 934 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 568 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 642 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 		 677 aa  73.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>