More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0382 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
576 aa  1184    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  44.24 
 
 
621 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  44.24 
 
 
621 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 
621 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  37.55 
 
 
677 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 
607 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 
579 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  34.33 
 
 
619 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.02 
 
 
610 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
610 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 
617 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 
593 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
572 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.09 
 
 
594 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  34.73 
 
 
593 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.24 
 
 
583 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
592 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  34.5 
 
 
592 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
585 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
617 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.15 
 
 
619 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
622 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.85 
 
 
633 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
595 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 
572 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  30.15 
 
 
584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
566 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
642 aa  213  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 
566 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  32.49 
 
 
425 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
612 aa  174  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 
573 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
599 aa  156  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
573 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
571 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
594 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 
557 aa  134  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
722 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
552 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  31.85 
 
 
562 aa  123  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.14 
 
 
603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 
553 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
572 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  26.62 
 
 
557 aa  120  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  26.84 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  39.22 
 
 
482 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 
573 aa  114  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.21 
 
 
573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 
607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
566 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 
606 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
607 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
607 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  32.39 
 
 
607 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
607 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.68 
 
 
586 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
607 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
607 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
594 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
613 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  30.04 
 
 
613 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  30.04 
 
 
573 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
613 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
568 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  31.34 
 
 
616 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  33 
 
 
609 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 
584 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
562 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
556 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
563 aa  97.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
573 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
592 aa  97.1  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  29.1 
 
 
575 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 
591 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.72 
 
 
635 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
616 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  27.27 
 
 
551 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
584 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 
574 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
565 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 
574 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
638 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  29.27 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.41 
 
 
574 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>