113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3010 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 421 aa  863    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.05 
 
 		 782 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 909 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 1313 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.09 
 
 		 809 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 1261 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  24.59 
 
 		 941 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 		 1266 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.04 
 
 		 2145 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 		 957 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  31.51 
 
 		 1147 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1238 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 1507 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.18 
 
 		 609 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  21.69 
 
 		 694 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  20.97 
 
 		 1180 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 991 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 1486 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  25.86 
 
 		 566 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 1154 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 714 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 		 3172 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  22.36 
 
 		 682 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1911 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1404 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.55 
 
 		 1044 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  24.58 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1550 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  19.86 
 
 		 985 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  21.39 
 
 		 650 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.93 
 
 		 1186 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.55 
 
 		 1441 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  18.64 
 
 		 755 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.79 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.31 
 
 		 1279 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 850 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 		 1160 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  26.53 
 
 		 788 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0665  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020482  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  20.44 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 		 576 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  26.13 
 
 		 1452 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  20.78 
 
 		 799 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 799 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 814 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 681 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 945 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.09 
 
 		 887 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.61 
 
 		 212 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1039 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 621 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 		 1429 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1298 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1596 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  25.68 
 
 		 830 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  22.57 
 
 		 740 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  26.7 
 
 		 982 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  25.9 
 
 		 834 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  22.47 
 
 		 928 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 979 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  23.42 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.35 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 857 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 		 833 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1907  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2736  hypothetical protein  26.86 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181142 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.33 
 
 		 771 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  22.52 
 
 		 827 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  25.71 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.91 
 
 		 810 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 621 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 685 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 1737 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1094 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  21.64 
 
 		 887 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2688  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  28.03 
 
 		 623 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 1105 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  21.59 
 
 		 2327 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  25.77 
 
 		 844 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.61 
 
 		 875 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 		 695 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>