55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2985 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 419 aa  862    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  59.52 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  44.55 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  41.65 
 
 		 415 aa  319  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  41.83 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  41.61 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 		 415 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  42.93 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  41.12 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  42.17 
 
 		 415 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  40.57 
 
 		 415 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  40.33 
 
 		 415 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  40.38 
 
 		 419 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  41.09 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  38.86 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  27.66 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  27.73 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  27.55 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.56 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  25.82 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  25.48 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.63 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.41 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  25.78 
 
 		 407 aa  97.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  26.82 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  28.7 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  24.18 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 3035 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  23.05 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  21.53 
 
 		 365 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 329 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 		 1694 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.16 
 
 		 746 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 1069 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  21.51 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1297 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.58 
 
 		 730 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 2240 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.25 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 750 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 543 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 758 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1856  hypothetical protein  26.79 
 
 		 340 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 3560 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>