286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1210 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  95 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  95 
 
 		 300 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  94.33 
 
 		 300 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  90.33 
 
 		 300 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  90.33 
 
 		 300 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  90 
 
 		 300 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  90 
 
 		 300 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  88.04 
 
 		 301 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 303 aa  427  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  67 
 
 		 302 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  68.24 
 
 		 302 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  65.88 
 
 		 296 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  67.69 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  65.54 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  62.67 
 
 		 301 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  48.18 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  42.8 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  43.68 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  43.01 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  43.37 
 
 		 294 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  44.2 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  42.65 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  43.57 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  43.68 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  43.21 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  43.84 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  41.32 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  41.22 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  40.14 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  39.58 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  38.87 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.91 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.77 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.08 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.48 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.11 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.63 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 1421 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.21 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.1 
 
 		 632 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 878 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.01 
 
 		 1022 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 1005 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 2240 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  35.96 
 
 		 706 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 634 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 629 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 361 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.23 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 		 511 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.24 
 
 		 1034 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1276 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.21 
 
 		 1240 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.39 
 
 		 585 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 280 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.69 
 
 		 1694 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  33.01 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.01 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 		 542 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.88 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>