227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0813 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  97.96 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  91.84 
 
 		 294 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  90.48 
 
 		 294 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  89.8 
 
 		 294 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  89.46 
 
 		 294 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  89.46 
 
 		 294 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  89.46 
 
 		 294 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  83.67 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  83.67 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  83.67 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  83.67 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  82.99 
 
 		 294 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  83.67 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  83.33 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  82.65 
 
 		 294 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  48.76 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  48.06 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  45.64 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  46.37 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  44.33 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  45.13 
 
 		 287 aa  241  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  44.81 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  43.26 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  43.79 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  41.84 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  45.49 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  44.57 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  44.77 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  44.57 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  42.18 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  43.68 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  44.04 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  44.04 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  44.04 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  41.13 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  43.68 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  40 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  38.25 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.09 
 
 		 820 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  35.23 
 
 		 385 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.67 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 706 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  32.64 
 
 		 538 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 505 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 649 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 754 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 1276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1121 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 632 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 836 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 585 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.56 
 
 		 988 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.98 
 
 		 742 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 621 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 621 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  43.94 
 
 		 605 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  41.43 
 
 		 668 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.44 
 
 		 1694 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 4079 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 718 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 4489 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 596 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 662 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 716 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.937373  decreased coverage  0.0000146209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1007 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1421 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.57 
 
 		 784 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 352 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 1022 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 602 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1827 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 366 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.41 
 
 		 708 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>