179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0603 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 327 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  55.37 
 
 		 303 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  55.15 
 
 		 307 aa  339  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  51.63 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  44.33 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  42.71 
 
 		 294 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  42.37 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  41.41 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  41.41 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  41.41 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  43.62 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  43.66 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  41.41 
 
 		 294 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  42.25 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  40.48 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  44.49 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  37.05 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  36.93 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  38.31 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  37.5 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  37.5 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  38.87 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  38.08 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  37.72 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  37.72 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  38.52 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  38.52 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  37.72 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  38.87 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  37.05 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  37.89 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  36.57 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  35.84 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  34.92 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 602 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 3301 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.46 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.68 
 
 		 820 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 3172 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 265 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 265 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23 
 
 		 725 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  29.41 
 
 		 584 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.85 
 
 		 1240 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.08 
 
 		 810 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.97 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1276 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 605 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 185 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 563 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 4079 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 621 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 699 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.21 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 542 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.5 
 
 		 739 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 		 271 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 762 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 		 1022 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 207 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 621 aa  46.2  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 601 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 540 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 750 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 621 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.05 
 
 		 706 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>