165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0179 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  100 
 
 
303 aa  618  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  68.44 
 
 
307 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  66.33 
 
 
306 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  56.01 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  47.57 
 
 
294 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0352311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  48.26 
 
 
294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  47.75 
 
 
294 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  47.39 
 
 
294 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  47.39 
 
 
294 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  47.39 
 
 
294 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  47.39 
 
 
294 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  47.39 
 
 
294 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  47.4 
 
 
294 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  47.22 
 
 
294 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  47.22 
 
 
294 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  47.22 
 
 
294 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  47.22 
 
 
294 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  46.37 
 
 
294 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  46.37 
 
 
294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  42.51 
 
 
303 aa  231  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  43.75 
 
 
296 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  41.36 
 
 
298 aa  222  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  40.99 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  40.61 
 
 
302 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  40.49 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  41.01 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  43.07 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  41.03 
 
 
303 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  41.3 
 
 
301 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  40.14 
 
 
300 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  40.5 
 
 
300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  40.5 
 
 
300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  40.07 
 
 
300 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  40.07 
 
 
300 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  40.07 
 
 
300 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  39.71 
 
 
300 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  39.78 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  39.45 
 
 
269 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  35.49 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.69 
 
 
820 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.49 
 
 
547 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
1121 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
649 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.45 
 
 
936 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
565 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 
1056 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
207 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.46 
 
 
810 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 
1022 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 
818 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.58 
 
 
385 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
878 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.96 
 
 
988 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
543 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  29.41 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.9 
 
 
1056 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 
632 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
784 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1828  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
633 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0732208  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
209 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.38 
 
 
706 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
4079 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  30.69 
 
 
584 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
1421 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
1069 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.22 
 
 
648 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  25.74 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  25.74 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.33 
 
 
1240 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.32 
 
 
594 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
699 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 
738 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 
219 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
284 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 
635 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.72 
 
 
643 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
1276 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
352 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
927 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
563 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
636 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>