218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2208 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  54.14 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  47.94 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  47.89 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  49.45 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  49.27 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  49.27 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  49.27 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  48.18 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  48.91 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  47.48 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  48.18 
 
 		 300 aa  258  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  46.35 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  45.85 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  47.08 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  46.18 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  47.08 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  47.08 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  49.41 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  46.93 
 
 		 301 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  49.41 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  49.41 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  49.41 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  49.8 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  48.22 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  45.13 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  44.4 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  43.43 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  43.8 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  45.76 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  44.28 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  43.07 
 
 		 303 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  44.49 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  38.69 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.11 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 547 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.57 
 
 		 820 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 649 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1421 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.08 
 
 		 511 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 699 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 361 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 352 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.88 
 
 		 1694 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1094 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.71 
 
 		 1056 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.22 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.22 
 
 		 706 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.25 
 
 		 706 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1827 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 617 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.36 
 
 		 878 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.23 
 
 		 542 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.48 
 
 		 988 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.38 
 
 		 742 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.96 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1281  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 816 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1005 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 828 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 629 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 452 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 392 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.29 
 
 		 746 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 		 784 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 3560 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 593 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>