208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2210 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  42.97 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  38.69 
 
 		 287 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  39.22 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  39.58 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  39.58 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  39.58 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  38.49 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  40.48 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  40.48 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  37.59 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  40.14 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  39.16 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  38.05 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  39.24 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  38.89 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  38.57 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  39.16 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  39.2 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  39.6 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  35.62 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  39.2 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  38.65 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  38.65 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  38.65 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  39.04 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  35.49 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  34.48 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  37.94 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  36.29 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  37.55 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  38.25 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  38.25 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  34.6 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  33.56 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 1276 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 594 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 4079 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.48 
 
 		 560 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 649 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.34 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 878 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 446 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.85 
 
 		 818 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 428 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.69 
 
 		 988 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  23.38 
 
 		 706 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 566 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1421 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 804 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 621 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.04 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  27.88 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.67 
 
 		 706 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.37 
 
 		 750 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 448 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 699 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 615 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 		 784 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 591 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 356 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 589 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 927 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 566 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 425 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 357 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.83 
 
 		 810 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  27.36 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 1022 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>