276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3341 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 294 aa  604  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  94.56 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  91.5 
 
 		 294 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  90.48 
 
 		 294 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  87.07 
 
 		 294 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  86.05 
 
 		 294 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  86.05 
 
 		 294 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  86.05 
 
 		 294 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  81.63 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  81.63 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  81.63 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  497  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  81.29 
 
 		 294 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  81.63 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  81.63 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  80.95 
 
 		 294 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  49.82 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  49.47 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  47.75 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  45.64 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  42.66 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  43.45 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  43.43 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  44.8 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  40.82 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  42.25 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  43.53 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  43.53 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  42.81 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  43.01 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  43.53 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  42.65 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  43.21 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  41.49 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  42.81 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  42.6 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  41.11 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  37.55 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  25.82 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.09 
 
 		 820 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 585 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 754 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 621 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  38.78 
 
 		 668 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 621 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 621 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 649 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 1276 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 572 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 632 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.67 
 
 		 397 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 522 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 605 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.46 
 
 		 988 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.93 
 
 		 706 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 615 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 4079 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1121 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  31.61 
 
 		 538 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1138 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  34.09 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.96 
 
 		 742 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 718 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 1694 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 602 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 662 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 505 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 836 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  37.14 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.52 
 
 		 784 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.41 
 
 		 708 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  37.14 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.13 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 594 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1421 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 566 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>