282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3555 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  87.5 
 
 		 302 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  75.17 
 
 		 296 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  71.92 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  68.33 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  68.33 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  68.11 
 
 		 301 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  68.33 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  67.67 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  67 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  68.97 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  67.82 
 
 		 298 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  58.76 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  48.18 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  42.03 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  43.05 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  42.05 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  42.6 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  43.64 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  44 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  44 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  44 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  44 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  44 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  43.27 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  42.65 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  43.01 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  42.96 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  40.99 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  39.16 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  37.05 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.42 
 
 		 820 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.1 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.77 
 
 		 706 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1694 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 818 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1276 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.32 
 
 		 784 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.97 
 
 		 742 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 988 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 594 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2357  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  31.07 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 1034 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1121 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 878 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1421 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  28.7 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 716 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 1005 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.52 
 
 		 810 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 689 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 542 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.39 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1827 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.38 
 
 		 739 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 2240 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 414 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.29 
 
 		 738 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.74 
 
 		 1979 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.21 
 
 		 581 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 762 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>