64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0457 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0457  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 421 aa  840    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0295186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1652  Tetratricopeptide TPR_4  27.82 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2157  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.757147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.72 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 1737 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 827 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 878 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.73 
 
 		 299 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1406 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 2240 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 565 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 229 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.95 
 
 		 887 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.51 
 
 		 810 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.07 
 
 		 935 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 3145 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 568 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 729 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 686 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.32 
 
 		 875 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.61 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 581 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 754 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 612 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 573 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  33.59 
 
 		 498 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 595 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.12 
 
 		 863 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 722 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 1154 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.71 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 619 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 789 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 605 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 209 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 828 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.67 
 
 		 602 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  24.86 
 
 		 520 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 4079 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 927 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1297 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 784 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.74 
 
 		 676 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 1979 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 520 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 469 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 750 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.04 
 
 		 614 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 566 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0844  hypothetical protein  21.94 
 
 		 744 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 1257 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 637 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>