19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1652 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1652  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 418 aa  829    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2157  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.757147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0457  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0295186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0844  hypothetical protein  29.2 
 
 		 744 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0481694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.13 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 563 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  27.27 
 
 		 533 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 		 2240 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.03 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 2262 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  22.26 
 
 		 604 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 584 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 927 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 934 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.79 
 
 		 614 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 931 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>