56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0844 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0844  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1506    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1652  Tetratricopeptide TPR_4  29.2 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 2240 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 4079 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 632 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1676 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.24 
 
 		 1694 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  29.41 
 
 		 202 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.51 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 428 aa  52  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 249 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  31.47 
 
 		 784 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.31 
 
 		 750 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  27.23 
 
 		 933 aa  50.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 602 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 383 aa  49.3  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.85 
 
 		 573 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 		 602 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.65 
 
 		 222 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 878 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 480 aa  48.5  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 		 566 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.43 
 
 		 733 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 280 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.72 
 
 		 810 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 344 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 		 562 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.38 
 
 		 1979 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 827 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 685 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0457  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 421 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0295186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  32.22 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  27.05 
 
 		 435 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 612 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 734 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1121 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 513 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 279 aa  45.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  18.64 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 384 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 615 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  20.19 
 
 		 468 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 667 aa  44.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  18.75 
 
 		 1004 aa  44.3  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  29.25 
 
 		 510 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  26.71 
 
 		 454 aa  44.3  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 1061 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>