169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4970 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1100    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  33.23 
 
 		 453 aa  140  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  26.98 
 
 		 575 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  30.45 
 
 		 311 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  26.9 
 
 		 353 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  26.85 
 
 		 353 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  26.01 
 
 		 353 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  29.64 
 
 		 590 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  29.04 
 
 		 346 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  26.64 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  25.71 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  26.62 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  26.57 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  30 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  26.86 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.49 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  26.58 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  24.45 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  26.85 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  26.83 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  26.1 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  27.17 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 878 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.7 
 
 		 1694 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.2 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 1737 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.26 
 
 		 1677 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.65 
 
 		 745 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  24.31 
 
 		 321 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 3172 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  25.81 
 
 		 373 aa  55.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 754 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 597 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 681 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 827 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 289 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.2 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 754 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 247 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 689 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 557 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.7 
 
 		 865 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.06 
 
 		 1979 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 612 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1676 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 		 632 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25 
 
 		 622 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.03 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.87 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.4 
 
 		 816 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.12 
 
 		 935 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.21 
 
 		 1764 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1297 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  26.73 
 
 		 299 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1005 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 3301 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 3560 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 886 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  32.43 
 
 		 319 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 3035 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1276 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1652  Tetratricopeptide TPR_4  27.39 
 
 		 418 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 465 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 2262 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.96 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 		 466 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.15 
 
 		 561 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 4079 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.27 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 583 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26 
 
 		 561 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 3145 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4929  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 		 979 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 636 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 481 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 667 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 573 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  21.65 
 
 		 573 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.18 
 
 		 739 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 414 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 414 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 323 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 306 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>