24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1713 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  87.12 
 
 		 396 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  99.48 
 
 		 388 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  72.55 
 
 		 394 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  72.83 
 
 		 394 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  64.69 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  40 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  39.44 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  27.98 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  27.86 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  23.22 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  21.61 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1919  hypothetical protein  24.37 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0683862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  22.07 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  25.11 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  22.1 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>