11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0811 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  779    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  30.4 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  28.34 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  25.54 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  28.23 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  29.06 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  26.17 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  30.94 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  23.67 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>