182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1385 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  822    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5445  hypothetical protein  25.26 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  0.835503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2165  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0208318  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0827  hypothetical protein  21.13 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.748424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 573 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.11 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 883 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.18 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 571 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 808 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 2240 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 573 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  24.43 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  24.87 
 
 		 503 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 		 1402 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 201 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.82 
 
 		 632 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 3560 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 280 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.75 
 
 		 884 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.59 
 
 		 602 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4089  TPR repeat-containing protein  20.1 
 
 		 604 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0357411  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 559 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 278 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 256 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2164  Tetratricopeptide domain protein  21.82 
 
 		 358 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  0.621045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1092 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 3035 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 800 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.66 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 599 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.89 
 
 		 668 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.88 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 606 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 870 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.43 
 
 		 661 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 792 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  27.07 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.25 
 
 		 3145 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 		 1014 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1030  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 190 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 729 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1091 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 767 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 587 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.39 
 
 		 883 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1681  hypothetical protein  22.19 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 557 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0613  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 274 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.326726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3708  TPR repeat-containing protein  19.62 
 
 		 604 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 2262 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 566 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1676 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.63 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 605 aa  46.6  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  32.88 
 
 		 288 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 357 aa  46.6  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.83 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 952 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 		 729 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.57 
 
 		 738 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  22.79 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  20.66 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>