32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4089 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4089  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1169    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0357411  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3708  TPR repeat-containing protein  87.73 
 
 		 604 aa  972    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7075  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.986881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.17 
 
 		 615 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  28.47 
 
 		 690 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  20.1 
 
 		 400 aa  50.8  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 311 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 		 875 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.85 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 632 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  19.81 
 
 		 905 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 878 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 1272 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 1198 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.78 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  19.08 
 
 		 681 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  19.87 
 
 		 810 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  43.33 
 
 		 593 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.93 
 
 		 545 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  35.87 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  37.14 
 
 		 576 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  26.97 
 
 		 191 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1297 aa  44.3  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  31.88 
 
 		 631 aa  44.3  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 4079 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 3560 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 1252 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 1252 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>