54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3708 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4089  TPR repeat-containing protein  87.73 
 
 		 604 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0357411  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3708  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1157    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7075  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 609 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.986881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.37 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 615 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 810 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  35.05 
 
 		 545 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.83 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 591 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 750 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.46 
 
 		 865 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.42 
 
 		 875 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 632 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  30.56 
 
 		 690 aa  47.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 448 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 199 aa  47.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  19.81 
 
 		 905 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 864 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  19.62 
 
 		 400 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  37.04 
 
 		 631 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.85 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 		 1056 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.58 
 
 		 622 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 221 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 		 824 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 715 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 543 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 199 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 1154 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 3172 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.46 
 
 		 742 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 366 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 4079 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 612 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.88 
 
 		 887 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.06 
 
 		 795 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 690 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.55 
 
 		 208 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.63 
 
 		 512 aa  43.9  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  38.16 
 
 		 1237 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.31 
 
 		 540 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1297 aa  43.9  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1005 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  40.28 
 
 		 648 aa  43.9  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 589 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 593 aa  43.9  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 		 1979 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.63 
 
 		 340 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 		 446 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>