More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0413 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1202    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  46.76 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  39.86 
 
 		 575 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  41.81 
 
 		 572 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  40.24 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  39.27 
 
 		 572 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  37.48 
 
 		 580 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  37.78 
 
 		 582 aa  339  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  26.67 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.01 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  26.72 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  26.72 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  27.25 
 
 		 403 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  26.54 
 
 		 769 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  25.84 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.26 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  27.87 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  29.06 
 
 		 727 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.49 
 
 		 397 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.14 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.76 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.76 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.21 
 
 		 763 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.21 
 
 		 763 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.34 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  30.21 
 
 		 716 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  29.62 
 
 		 844 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  30.21 
 
 		 763 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  29.62 
 
 		 766 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.3 
 
 		 752 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  29.91 
 
 		 769 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  30.38 
 
 		 756 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.41 
 
 		 749 aa  100  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  25.88 
 
 		 746 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.68 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.12 
 
 		 752 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  29.32 
 
 		 736 aa  97.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  26.41 
 
 		 757 aa  94.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  25.42 
 
 		 762 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.92 
 
 		 424 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  27.03 
 
 		 745 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.39 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.33 
 
 		 745 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.33 
 
 		 745 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  24.42 
 
 		 389 aa  87  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.8 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.88 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25.87 
 
 		 745 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 878 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.17 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 927 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.29 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  24.3 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  23.4 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.43 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 162 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 3560 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  24.58 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  22.44 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.09 
 
 		 875 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  24.62 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.22 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.86 
 
 		 1056 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  22.29 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.15 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1276 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  24.15 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  36.57 
 
 		 582 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  24.79 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  22.29 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  22.52 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.28 
 
 		 1694 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.46 
 
 		 267 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 626 aa  67  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.59 
 
 		 573 aa  67  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.07 
 
 		 620 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1094 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.5 
 
 		 1034 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 1737 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  24.22 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 		 1067 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  24.45 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 1486 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  25.09 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  24.82 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  24.58 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  22.4 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.95 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 3172 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.97 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>